Краткая биография:
Сергей Витауто Пускепалис родился в Курске. Отец — литовец, мать — болгарка, родом из Молдавской ССР. Болгарским языком не владел, литовский хорошо знал в детстве, потому что отец Витаутас часто на лето отвозил сына в Каунас, где проживала его мать Данута.
В 1980 году вместе с семьёй переехал в Саратов.
В 1985 году окончил Саратовское театральное училище (курс Юрия Киселёва). Затем прошёл трёхгодичную срочную службу в Североморске, в Военно-морском флоте СССР.
После увольнения в запас, в 1988 году, в звании старшины первой статьи, вернулся в Саратов. Более десяти лет проработал актёром в Саратовском театре юного зрителя имени Ю. П. Киселёва (ТЮЗе). Был женат на Эльвире Данилиной (род. 29 сентября 1965), уроженке Саратова, актрисе, выпускнице Саратовского театрального училища, артистке Саратовского государственного академического театра драмы.
В 2001 году в Москве окончил режиссёрский факультет РАТИ (ГИТИСа) (курс профессора Петра Фоменко).
После выпуска из РАТИ поставил в Москве пьесу «Двадцать семь» Алексея Слаповского — этот спектакль участвовал в одном из фестивалей «Балтийский дом». Затем поставил спектакль «От красной крысы до зелёной звезды» по пьесам Слаповского в омском «Пятом театре». Пускепалис и Слаповский были постоянными соавторами, Пускепалис неоднократно ставил спектакли по пьесам Слаповского.
Работал режиссёром в самарском театре «Понедельник».
С мая 2003 по 2007 год — главный режиссёр Магнитогорского драматического театра имени А. С. Пушкина.
С 2007 года — режиссёр-постановщик Московского театра-студии под руководством Олега Табакова.
С июня 2009 по февраль 2010 года — главный режиссёр Российского государственного академического театра драмы имени Фёдора Волкова (Ярославль).
Для постановок спектаклей приглашался самыми известными драматическими театрами России.
В 1991 году женился на Елене Петровой.
В кино снимается с 2003 года. Первая роль была эпизодической — в художественном фильме режиссёра Алексея Учителя «Прогулка» (2003).
С кинорежиссёром Алексеем Попогребским познакомился, когда приехал на съёмки фильма «Коктебель» (2003), в котором снимался его сын — Глеб Пускепалис (род. 5 июля 1992, Железноводск). Позднее Попогребский пригласил Сергея на главные роли в фильмах «Простые вещи» (2006) и «Как я провёл этим летом» (2010).
В Магнитогорске вёл курс на театральном факультете Магнитогорской государственной консерватории имени М. И. Глинки.
В 2015 году на кинофестивале «Золотой абрикос» в Ереване состоялась премьера фильма «Клинч», который Сергей Пускепалис снял в качестве кинорежиссёра. Это экранизация пьесы Алексея Слаповского, которую Пускепалис ранее ставил в Уфе.
4 декабря 2018 года назначен заместителем художественного руководителя МХАТ имени Горького по творческой работе.
В феврале 2020 года, на учредительном съезде партии «За правду» был избран заместителем её председателя. В феврале 2021 года стал членом Центрального совета партии «Справедливая Россия — За правду» после объединения этих партий.
Семья Сергея Пускепалиса проживает в городе Железноводске Ставропольского края.
20 сентября 2022 года Сергей Пускепалис погиб в ДТП в Ярославской области. Автомобиль Ford Transit, в котором ехал актёр, передвигаясь по трассе М-8, вылетел на встречную полосу и врезался в грузовой автомобиль. Актёр и водитель микроавтобуса погибли.